医师资格考试的合格线由卫生部医师资格考试委员会确定，并于每年的11-12月间向社会公告。2016年医师资格考试医学综合笔试合格分数线公布时间为2016年12月3日，2016年医师资格考试医学综合笔试合格线分数线（执业医师综合笔试满分为600分，助理医师综合笔试满分为300分）。由于部分省市一年两试的开展，可以预见今后考生会比往年更快的知晓考试分数。

经国家卫生计生委医师资格考试委员会2016年12月2日全体会议研究决定，自2016年起，医师资格考试医学综合笔试部分类别执行固定合格分数线，分别为：
　　临床执业医师：360
　　临床执业助理医师：180
　　公共卫生执业医师：360
　　公共卫生执业助理医师：180
　　具有规定学历的中医执业医师：360
　　具有规定学历的中医执业助理医师：180
　　师承或确有专长中医执业医师：360
　　师承或确有专长中医执业助理医师：180
　　中西医结合执业医师：360
　　中西医结合执业助理医师：180
　　2016年口腔执业医师、口腔执业助理医师、乡村全科执业助理医师、中医类别民族医执业医师、中医类别民族医执业助理医师等不执行固定合格分数线政策。
　　2016年口腔类别医师资格考试医学综合笔试合格分数线为：
　　口腔执业医师：360
　　口腔执业助理医师：184
　　2016年乡村全科执业助理医师资格考试医学综合笔试合格分数线为：170
　　2016年中医类别民族医医师资格考试医学综合笔试合格分数线为：
　　具有规定学历的蒙医执业医师：293
　　具有规定学历的蒙医执业助理医师：126
　　师承或确有专长蒙医执业医师：293
　　师承或确有专长蒙医执业助理医师：126
　　具有规定学历的藏医执业医师：310
　　具有规定学历的藏医执业助理医师：145
　　师承或确有专长藏医执业医师：310
　　师承或确有专长藏医执业助理医师：145
　　具有规定学历的维医执业医师：351
　　具有规定学历的维医执业助理医师：163
　　师承或确有专长维医执业医师：351
　　师承或确有专长维医执业助理医师：163
　　具有规定学历的哈萨克医执业医师：199
　　具有规定学历的哈萨克医执业助理医师：82
　　具有规定学历的中医（壮医）专业执业医师：260
　　具有规定学历的中医（壮医）专业执业助理医师：122
　　师承或确有专长中医（壮医）专业执业助理医师：122